Recientemente se ha observado la reaparición de la pesca ilegal del pez Napoleón (Cheilinus undulatus). La organización ambiental internacional “Greenpeace” también ha observado especies en peligro de extinción en el mercado de pescado taiwanés previo a los festejos del Año Nuevo Lunar, lo que refleja el problema de la gestión en alta mar. El director del proyecto marino de "Greenpeace", Chung Meng-xun señaló que la producción anual de la pesquería en Taiwán, alcanzó las 400 000 toneladas métricas en la década de 1980, y el valor de la producción fue de alrededor de USD 1600 millones, pero que posteriormente estos valores han ido disminuyendo. Chung recalcó que el número de especies de peces en las aguas del norte de la isla se ha reducido de 142 a 37 especies en los últimos 15 años.
Chung enfatizó que 105 especies de peces han desaparecido en la costa del norte de Taiwán, y la captura de recursos pesqueros también ha caído en un 52%. En cuanto al valor de la producción, tras la corrección del índice de precios, la industria ha perdido también USD 27 900 millones.
Shao Kuang-chao, ex director del Centro de Investigación de la Biodiversidad de la Academia Sínica, dijo que las zonas de protección marinas de Taiwán cubren el 8.16% del total. Sin embargo, si se calcula de acuerdo con los estándares actuales de la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza (UICN), este porcentaje es en realidad más bajo. Además, la mayoría de las áreas de conservación marina no han implementado una óptima gestión y prohibiciones. No se ha implementado un monitoreo de estudios ecológicos a largo plazo ni una evaluación de la calidad de la gestión.
Shao enfatizó que un informe internacional en el que se utilizaron resultados de 60 análisis de grandes bases de datos estimó que el ecosistema marino de la isla podría desaparecer en el año 2048.